Владимир Давыдов писал(а):
Это предположительное цифровое выражение слов :" большинство мутаций являются вредными". Дайте свою цифру.
Тогда эта цифра должна быть меньше единицы. Насколько я представляю - более 90% мутаций являются нейтральными (учитывая, что 90% генома вообще не работают, а в белках порядка 25% мутаций синонимичны), из оставшихся большинство либо очень слабо вредны, либо очень слабо полезны. Чтобы узнать точную долю откровенно вредных мутаций, думаю, надо обращаться к исследованиям по наследственным заболеваниям. Но грубую оценку можно произвести - поскольку в среднем на поколение 60 мутаций, а дети в большинстве своём выживают, то вредных мутаций должно быть заметно меньше одного процента от общего числа. Хотя здесь ещё есть различные приколы с гетерозиготностью и прочим взаимодействием генов.
Владимир Давыдов писал(а):
Итак получается, что в ЭРВ вредные мутации отсеиваются и за 5.5-7млн лет в принятой в качестве примера общей для человека и шимпанзе в 299 нуклеотидов последовательности могло произойти порядка 4-5 мутаций, что позволяет узнать эту последовательность.
Ну приблизительно так. По-хорошему здесь надо строить отдельную модель, учитывающую, что происходит два по сути вложенных цикла размножения - размножение человека (генома) и размножение МГЭ. В принципе, пользуясь только данными википедии и силой разума, можно оценить скорость размножения МГЭ, но надо хорошо подумать. Возможно, я даже это сделаю, но не сейчас.
Владимир Давыдов писал(а):
Вы говорите о нейтральных/полезных мутациях, я же пытался подсчитать количество всех (включая вредные) которые могут сохраняться в неработающих участках гена.
Ежели участок неработающий - то все изменения в нём по определению нейтральны. Разве что те, которые возвращают его к жизни, но ими можно пренебречь.
Владимир Давыдов писал(а):
Но на сколько я понял Вы утверждаете что общий ЭРВ шимпанзе и человека работающий.
Скажем так, когда человек и шимпанзе ещё не разделились, у них явно присутствовали работающие алу-повторы. Вот сохранились ли именно эти их экземпляры (а ежели сохранились, то в работающем ли состоянии) в современных людях и шимпанзе - большой вопрос. Ежели принять, что из генома они довольно регулярно вырезаются (что следует из данных википедии) - то возможно, что и не сохранились. А ежели всё же сохранились, то я думаю, что они должны были сохранить работоспособность, ибо 1,8 мутации - не так уж много.